洛阳多元科技有限公司未经批准，于2006年4月擅自占用洛阳市老城区邙山镇葛家岭村基本农田2655平方米建厂房，此行为违反了《中华人民共和国土地管理法》第2条之规定，属非法占用土地行为。依据《中华人民共和国土地管理法》第76条和《中华人民共和国土地管理法实施条例》第42条之规定，对洛阳多元科技有限公司处罚如下：

　　1、责令洛阳多元科技有限公司退还非法占用的土地，拆除在非法占用土地上新建的建筑物和其他设施，恢复土地原状。

　　2、对洛阳多元科技有限公司非法占用土地的行为处以罚款79650元。

　　洛阳多元科技有限公司逾期未履行处罚决定。洛阳市国土资源局于2006年10月30日依法申请市中级人民法院强制执行。